Ο Ανδρούτσος, αφού παραδόθηκε στους άνδρες του Γ. Γκούρα, οδηγήθηκε στην φυλακή Κούλε στα Προπύλαια της Ακρόπολης. Τότε δημιουργήθηκε κίνηση από άλλους σημαίνοντες στρατηγούς, όπως ο Γ. Καραϊσκάκης, για την απελευθέρωση του και για την καθαίρεση του Γ. Γκούρα. Ωστόσο παρ' όλες τις παρεμβάσεις που έγιναν, ο Ανδρούτσος παρέμεινε φυλακισμένος. Τα μεσάνυχτα της 5ης Ιουνίου 1825, μετά από δύο μήνες παραμονής του Ανδρούτσου στη φυλακή, ο Μαμούρης με δύο συντρόφους του, ενεργώντας με εντολές του Γκούρα, μπήκαν στο κελί του και τον θανάτωσαν. Ύστερα τον πέταξαν από την φυλακή και διέδωσαν ότι σκοτώθηκε στην προσπάθεια του να αποδράσει.