Η πολιορκία της Ακρόπολης, μετά την καταστροφή στον Ανάλατο μπήκε πλέον σε πολύ δύσκολη φάση για τους πολιορκημένους και ήταν πλέον θέμα χρόνου η παράδοση της. Όλοι οι έγκλειστοι αρχηγοί είχαν απορρίψει την ιδέα της παράδοσης, έχοντας ως παράδειγμα τους ηρωικούς υπερασπιστές του Μεσολογγίου. Ο Κόχραν ήρθε σε συμφωνία με τον αρχηγό των Γάλλων Δεριγνύ προκειμένου να μεσολαβήσει, ώστε να παραδοθούν με συνθήκη οι κλεισμένοι στην Ακρόπολη. Στις 24 Μαίου μετά από πολλές συμφωνίες και διαπραγματεύσεις ο Κιουταχής υπέγραψε την συνθήκη που αποτελείτο από 11 άρθρα, μεταξύ των οποίων ένα που προέβλεπε ότι οι πολιορκημένοι θα έφευγαν με τα όπλα τους. Πράγματι στις 25 Μαίου 1827, οι πολιορκημένοι εγκατέλειψαν την Ακρόπολη και αναχώρησαν με γαλλικά και αυστριακά πλοία για την Σαλαμίνα. Αυτό ήταν το τέλος της πολύμηνης πολιορκίας της Ακρόπολης αφο΄πλέον φάνηκε ξεκάθαρα ότι, μετά τον θάνατο του Καραισκάκη, τα πάντα είχαν χαθεί. Από τότε και μέχρι την καταστροφή του τορκοαιγυπτιακού στόλου στο Ναυαρίνο στις 8 Οκτωβρίου 1827 από τις Μεγάλες Δυνάμεις, οι Τούρκοι με τον Κιουταχή είχαν κυριαρχήσει σε όλη την Αττική, εκτός της Μεγαρίδας και της Ανατολικής Στερεάς.